开源软件可以为计算化学家节省大量时间

新软件可以简化计算化学实验的创建、启动和分析。 这款名为 AQME 的软件可免费使用，并获得开源许可。 它可以帮助提高计算效率并加速自动化分析。

Juan Vicente Alegre Requena 是这项研究的主要作者。 他在萨拉戈萨的化学合成和均相催化研究所工作。 他解释说，在现代分子模拟器中，单个化学反应的研究涉及 500 多次计算。 生成所有输入文件、启动计算以及分析结果所花费的时间非常长，尤其是在出现意外错误时。

Alegre 和他的同事们决定创建一个软件，使他们能够绕过计算过程中的几个步骤并加快计算速度。 AQME 有很多优点。 它使用简单的输入而不是其他解决方案通常需要的 3D 化学结构。 “这非常容易，”Alegre 说。 AQME 可以在几分钟内安装完毕。 唯一需要的输入是 Smiles 字符串。 Smiles 是由化学家 Dave Weininger 在 80 年代后期开发的，他是一名程序员。 它将复杂的化学结构转换为一系列机器可读的字母和数值。 Alegre 说，Smiles 的交叉兼容性可以实现与机器学习和化学数据库的集成，这些数据库主要基于 Smiles 数据集。

来源和详细信息：
https://www.chemistryworld.com/news/open-source-software-could-deliver-huge-time-savings-for-computational-chemists/4017109.article